Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GNPDA1P46926 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GNPDA1P46926 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GNPDA1P46926 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GNPDA1P46926 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GNPDA1P46926 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GNPDA1P46926 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GNPDA1P46926 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GNPDA1P46926 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GNPDA1P46926 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GNPDA1P46926 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GNPDA1P46926 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GNPDA1P46926 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GNPDA1P46926 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GNPDA1P46926 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GNPDA1P46926 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GNPDA1P46926 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GNPDA1P46926 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GNPDA1P46926 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GNPDA1P46926 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GNPDA1P46926 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GNPDA1P46926 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GNPDA1P46926 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GNPDA1P46926 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GNPDA1P46926 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GNPDA1P46926 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GNPDA1P46926 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GNPDA1P46926 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GNPDA1P46926 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GNPDA1P46926 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GNPDA1P46926 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GNPDA1P46926 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GNPDA1P46926 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GNPDA1P46926 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GNPDA1P46926 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GNPDA1P46926 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GNPDA1P46926 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GNPDA1P46926 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GNPDA1P46926 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GNPDA1P46926 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GNPDA1P46926 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GNPDA1P46926 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GNPDA1P46926 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GNPDA1P46926 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GNPDA1P46926 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GNPDA1P46926 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GNPDA1P46926 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GNPDA1P46926 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GNPDA1P46926 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GNPDA1P46926 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GNPDA1P46926 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GNPDA1P46926 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GNPDA1P46926 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GNPDA1P46926 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GNPDA1P46926 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GNPDA1P46926 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GNPDA1P46926 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GNPDA1P46926 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GNPDA1P46926 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GNPDA1P46926 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GNPDA1P46926 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GNPDA1P46926 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GNPDA1P46926 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GNPDA1P46926 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GNPDA1P46926 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GNPDA1P46926 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GNPDA1P46926 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GNPDA1P46926 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GNPDA1P46926 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GNPDA1P46926 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GNPDA1P46926 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GNPDA1P46926 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GNPDA1P46926 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GNPDA1P46926 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GNPDA1P46926 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GNPDA1P46926 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GNPDA1P46926 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GNPDA1P46926 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GNPDA1P46926 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GNPDA1P46926 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GNPDA1P46926 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GNPDA1P46926 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GNPDA1P46926 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GNPDA1P46926 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GNPDA1P46926 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GNPDA1P46926 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GNPDA1P46926 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GNPDA1P46926 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GNPDA1P46926 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GNPDA1P46926 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GNPDA1P46926 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GNPDA1P46926 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GNPDA1P46926 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GNPDA1P46926 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GNPDA1P46926 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GNPDA1P46926 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GNPDA1P46926 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GNPDA1P46926 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GNPDA1P46926 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GNPDA1P46926 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms