Protein–RNA interactions for Protein: P46013

MKI67, Proliferation marker protein Ki-67, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKI67P46013 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MKI67P46013 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MKI67P46013 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MKI67P46013 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MKI67P46013 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MKI67P46013 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MKI67P46013 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MKI67P46013 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
MKI67P46013 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
MKI67P46013 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
MKI67P46013 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
MKI67P46013 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MKI67P46013 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MKI67P46013 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
MKI67P46013 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MKI67P46013 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MKI67P46013 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MKI67P46013 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
MKI67P46013 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MKI67P46013 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MKI67P46013 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MKI67P46013 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MKI67P46013 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MKI67P46013 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MKI67P46013 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MKI67P46013 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MKI67P46013 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MKI67P46013 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MKI67P46013 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MKI67P46013 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MKI67P46013 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MKI67P46013 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MKI67P46013 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MKI67P46013 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MKI67P46013 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MKI67P46013 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MKI67P46013 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MKI67P46013 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
MKI67P46013 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
MKI67P46013 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MKI67P46013 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MKI67P46013 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MKI67P46013 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MKI67P46013 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MKI67P46013 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MKI67P46013 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
MKI67P46013 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MKI67P46013 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MKI67P46013 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MKI67P46013 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MKI67P46013 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MKI67P46013 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MKI67P46013 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MKI67P46013 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MKI67P46013 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MKI67P46013 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MKI67P46013 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
MKI67P46013 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MKI67P46013 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
MKI67P46013 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MKI67P46013 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MKI67P46013 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MKI67P46013 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MKI67P46013 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
MKI67P46013 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MKI67P46013 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MKI67P46013 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MKI67P46013 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MKI67P46013 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MKI67P46013 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MKI67P46013 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MKI67P46013 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MKI67P46013 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MKI67P46013 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MKI67P46013 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MKI67P46013 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MKI67P46013 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MKI67P46013 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MKI67P46013 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MKI67P46013 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MKI67P46013 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
MKI67P46013 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MKI67P46013 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
MKI67P46013 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MKI67P46013 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MKI67P46013 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MKI67P46013 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MKI67P46013 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MKI67P46013 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MKI67P46013 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MKI67P46013 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MKI67P46013 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MKI67P46013 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MKI67P46013 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MKI67P46013 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MKI67P46013 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MKI67P46013 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
MKI67P46013 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MKI67P46013 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MKI67P46013 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms