Protein–RNA interactions for Protein: P43307

SSR1, Translocon-associated protein subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR1P43307 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSR1P43307 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSR1P43307 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSR1P43307 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSR1P43307 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSR1P43307 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SSR1P43307 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SSR1P43307 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SSR1P43307 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SSR1P43307 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SSR1P43307 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SSR1P43307 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SSR1P43307 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SSR1P43307 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SSR1P43307 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SSR1P43307 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SSR1P43307 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SSR1P43307 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SSR1P43307 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SSR1P43307 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SSR1P43307 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SSR1P43307 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SSR1P43307 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SSR1P43307 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SSR1P43307 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SSR1P43307 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SSR1P43307 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SSR1P43307 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SSR1P43307 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SSR1P43307 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SSR1P43307 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SSR1P43307 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SSR1P43307 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SSR1P43307 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SSR1P43307 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SSR1P43307 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSR1P43307 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSR1P43307 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSR1P43307 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSR1P43307 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSR1P43307 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSR1P43307 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSR1P43307 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSR1P43307 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSR1P43307 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSR1P43307 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSR1P43307 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SSR1P43307 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSR1P43307 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SSR1P43307 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SSR1P43307 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SSR1P43307 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SSR1P43307 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SSR1P43307 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SSR1P43307 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSR1P43307 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSR1P43307 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSR1P43307 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSR1P43307 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSR1P43307 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSR1P43307 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSR1P43307 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSR1P43307 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSR1P43307 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SSR1P43307 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SSR1P43307 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SSR1P43307 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SSR1P43307 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SSR1P43307 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SSR1P43307 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SSR1P43307 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SSR1P43307 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SSR1P43307 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SSR1P43307 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SSR1P43307 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SSR1P43307 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SSR1P43307 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SSR1P43307 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SSR1P43307 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SSR1P43307 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SSR1P43307 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SSR1P43307 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SSR1P43307 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SSR1P43307 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SSR1P43307 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SSR1P43307 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SSR1P43307 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SSR1P43307 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SSR1P43307 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SSR1P43307 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SSR1P43307 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SSR1P43307 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SSR1P43307 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SSR1P43307 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SSR1P43307 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SSR1P43307 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SSR1P43307 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SSR1P43307 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SSR1P43307 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
SSR1P43307 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms