Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MCAMP43121 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MCAMP43121 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MCAMP43121 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MCAMP43121 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MCAMP43121 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MCAMP43121 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MCAMP43121 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MCAMP43121 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MCAMP43121 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MCAMP43121 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MCAMP43121 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MCAMP43121 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MCAMP43121 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MCAMP43121 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MCAMP43121 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
MCAMP43121 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MCAMP43121 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MCAMP43121 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
MCAMP43121 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
MCAMP43121 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MCAMP43121 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MCAMP43121 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MCAMP43121 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MCAMP43121 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
MCAMP43121 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MCAMP43121 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MCAMP43121 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MCAMP43121 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MCAMP43121 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MCAMP43121 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MCAMP43121 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MCAMP43121 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MCAMP43121 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MCAMP43121 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MCAMP43121 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MCAMP43121 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MCAMP43121 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MCAMP43121 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MCAMP43121 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MCAMP43121 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MCAMP43121 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
MCAMP43121 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MCAMP43121 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MCAMP43121 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MCAMP43121 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MCAMP43121 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MCAMP43121 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MCAMP43121 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MCAMP43121 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MCAMP43121 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MCAMP43121 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
MCAMP43121 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
MCAMP43121 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MCAMP43121 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MCAMP43121 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MCAMP43121 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MCAMP43121 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MCAMP43121 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MCAMP43121 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MCAMP43121 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MCAMP43121 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
MCAMP43121 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MCAMP43121 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MCAMP43121 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MCAMP43121 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MCAMP43121 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MCAMP43121 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MCAMP43121 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MCAMP43121 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
MCAMP43121 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MCAMP43121 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MCAMP43121 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MCAMP43121 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MCAMP43121 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MCAMP43121 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MCAMP43121 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MCAMP43121 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MCAMP43121 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MCAMP43121 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MCAMP43121 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MCAMP43121 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
MCAMP43121 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MCAMP43121 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MCAMP43121 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
MCAMP43121 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MCAMP43121 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MCAMP43121 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MCAMP43121 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MCAMP43121 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MCAMP43121 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MCAMP43121 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MCAMP43121 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
MCAMP43121 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MCAMP43121 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MCAMP43121 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MCAMP43121 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MCAMP43121 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MCAMP43121 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
MCAMP43121 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms