Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCKARP32238 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCKARP32238 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCKARP32238 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCKARP32238 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCKARP32238 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCKARP32238 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCKARP32238 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCKARP32238 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCKARP32238 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCKARP32238 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCKARP32238 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCKARP32238 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCKARP32238 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCKARP32238 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCKARP32238 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CCKARP32238 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCKARP32238 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCKARP32238 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCKARP32238 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCKARP32238 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCKARP32238 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCKARP32238 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCKARP32238 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCKARP32238 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCKARP32238 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCKARP32238 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCKARP32238 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCKARP32238 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCKARP32238 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCKARP32238 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCKARP32238 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCKARP32238 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCKARP32238 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCKARP32238 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CCKARP32238 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCKARP32238 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCKARP32238 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCKARP32238 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCKARP32238 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCKARP32238 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCKARP32238 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCKARP32238 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCKARP32238 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCKARP32238 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCKARP32238 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCKARP32238 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCKARP32238 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCKARP32238 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CCKARP32238 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCKARP32238 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCKARP32238 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCKARP32238 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCKARP32238 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCKARP32238 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCKARP32238 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCKARP32238 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCKARP32238 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCKARP32238 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCKARP32238 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCKARP32238 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCKARP32238 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCKARP32238 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCKARP32238 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCKARP32238 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCKARP32238 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CCKARP32238 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CCKARP32238 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCKARP32238 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CCKARP32238 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCKARP32238 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CCKARP32238 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCKARP32238 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCKARP32238 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCKARP32238 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCKARP32238 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CCKARP32238 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCKARP32238 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCKARP32238 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCKARP32238 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCKARP32238 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCKARP32238 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CCKARP32238 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCKARP32238 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCKARP32238 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCKARP32238 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCKARP32238 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCKARP32238 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCKARP32238 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CCKARP32238 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CCKARP32238 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCKARP32238 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCKARP32238 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCKARP32238 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCKARP32238 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CCKARP32238 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCKARP32238 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCKARP32238 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCKARP32238 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCKARP32238 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.4 ms