Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GTF2E2P29084 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GTF2E2P29084 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GTF2E2P29084 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GTF2E2P29084 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GTF2E2P29084 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GTF2E2P29084 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GTF2E2P29084 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GTF2E2P29084 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GTF2E2P29084 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
GTF2E2P29084 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GTF2E2P29084 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GTF2E2P29084 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GTF2E2P29084 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GTF2E2P29084 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GTF2E2P29084 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GTF2E2P29084 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GTF2E2P29084 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GTF2E2P29084 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GTF2E2P29084 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GTF2E2P29084 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GTF2E2P29084 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GTF2E2P29084 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GTF2E2P29084 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GTF2E2P29084 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
GTF2E2P29084 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GTF2E2P29084 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GTF2E2P29084 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GTF2E2P29084 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GTF2E2P29084 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GTF2E2P29084 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GTF2E2P29084 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GTF2E2P29084 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GTF2E2P29084 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GTF2E2P29084 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GTF2E2P29084 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GTF2E2P29084 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GTF2E2P29084 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GTF2E2P29084 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GTF2E2P29084 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GTF2E2P29084 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GTF2E2P29084 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GTF2E2P29084 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GTF2E2P29084 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GTF2E2P29084 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GTF2E2P29084 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF2E2P29084 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF2E2P29084 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF2E2P29084 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF2E2P29084 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF2E2P29084 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF2E2P29084 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF2E2P29084 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF2E2P29084 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF2E2P29084 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF2E2P29084 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GTF2E2P29084 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
GTF2E2P29084 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF2E2P29084 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF2E2P29084 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF2E2P29084 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF2E2P29084 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF2E2P29084 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF2E2P29084 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GTF2E2P29084 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF2E2P29084 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF2E2P29084 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF2E2P29084 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF2E2P29084 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF2E2P29084 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF2E2P29084 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF2E2P29084 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF2E2P29084 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF2E2P29084 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF2E2P29084 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF2E2P29084 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF2E2P29084 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GTF2E2P29084 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GTF2E2P29084 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GTF2E2P29084 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GTF2E2P29084 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GTF2E2P29084 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
GTF2E2P29084 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GTF2E2P29084 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GTF2E2P29084 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GTF2E2P29084 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GTF2E2P29084 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GTF2E2P29084 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GTF2E2P29084 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GTF2E2P29084 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GTF2E2P29084 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GTF2E2P29084 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
GTF2E2P29084 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GTF2E2P29084 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GTF2E2P29084 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GTF2E2P29084 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GTF2E2P29084 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GTF2E2P29084 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GTF2E2P29084 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GTF2E2P29084 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms