Protein–RNA interactions for Protein: P26045

PTPN3, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN3P26045 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN3P26045 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN3P26045 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN3P26045 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN3P26045 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN3P26045 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN3P26045 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN3P26045 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN3P26045 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN3P26045 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN3P26045 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN3P26045 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN3P26045 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN3P26045 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN3P26045 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN3P26045 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN3P26045 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN3P26045 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN3P26045 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN3P26045 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN3P26045 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN3P26045 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN3P26045 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN3P26045 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN3P26045 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN3P26045 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN3P26045 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN3P26045 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN3P26045 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN3P26045 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN3P26045 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN3P26045 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN3P26045 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN3P26045 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN3P26045 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPN3P26045 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPN3P26045 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPN3P26045 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPN3P26045 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPN3P26045 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPN3P26045 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPN3P26045 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPN3P26045 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPN3P26045 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPN3P26045 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPN3P26045 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPN3P26045 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPN3P26045 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN3P26045 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN3P26045 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN3P26045 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN3P26045 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN3P26045 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN3P26045 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN3P26045 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN3P26045 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN3P26045 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN3P26045 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN3P26045 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN3P26045 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN3P26045 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN3P26045 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN3P26045 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN3P26045 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN3P26045 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN3P26045 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN3P26045 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPN3P26045 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPN3P26045 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPN3P26045 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPN3P26045 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPN3P26045 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPN3P26045 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPN3P26045 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPN3P26045 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPN3P26045 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPN3P26045 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPN3P26045 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPN3P26045 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPN3P26045 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPN3P26045 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPN3P26045 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPN3P26045 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPN3P26045 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN3P26045 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN3P26045 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN3P26045 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN3P26045 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN3P26045 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN3P26045 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN3P26045 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN3P26045 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN3P26045 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN3P26045 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN3P26045 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN3P26045 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPN3P26045 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPN3P26045 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPN3P26045 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPN3P26045 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms