Protein–RNA interactions for Protein: P23396

RPS3, 40S ribosomal protein S3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3P23396 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.239e-12■■■■■ 34.3
RPS3P23396 GMPR2-207ENST00000558007 469 ntTSL 216■□□□□ 0.159e-12■■■■■ 34.3
RPS3P23396 GMPR2-211ENST00000558748 657 ntTSL 315.97■□□□□ 0.159e-12■■■■■ 34.3
RPS3P23396 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.089e-12■■■■■ 34.3
RPS3P23396 GMPR2-209ENST00000558483 857 ntTSL 314.89□□□□□ -0.039e-12■■■■■ 34.3
RPS3P23396 GMPR2-229ENST00000561038 2160 ntTSL 1 (best)14.47□□□□□ -0.099e-12■■■■■ 34.3
RPS3P23396 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.139e-12■■■■■ 34.3
RPS3P23396 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.139e-12■■■■■ 34.3
RPS3P23396 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.189e-12■■■■■ 34.3
RPS3P23396 GMPR2-224ENST00000559910 1562 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.329e-12■■■■■ 34.3
RPS3P23396 GMPR2-201ENST00000348719 1684 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.349e-12■■■■■ 34.3
RPS3P23396 GMPR2-205ENST00000456667 1484 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.429e-12■■■■■ 34.3
RPS3P23396 GMPR2-218ENST00000559287 1748 ntTSL 1 (best)12.23□□□□□ -0.459e-12■■■■■ 34.3
RPS3P23396 GMPR2-202ENST00000355299 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.479e-12■■■■■ 34.3
RPS3P23396 GMPR2-214ENST00000558865 735 ntTSL 511.17□□□□□ -0.629e-12■■■■■ 34.3
RPS3P23396 GMPR2-203ENST00000399440 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.969e-12■■■■■ 34.3
RPS3P23396 GMPR2-225ENST00000559943 360 ntTSL 38.74□□□□□ -1.019e-12■■■■■ 34.3
RPS3P23396 LBR-206ENST00000441022 536 ntTSL 24.35□□□□□ -1.718e-7■■■■■ 34.3
RPS3P23396 OAT-202ENST00000467675 810 ntTSL 59.6□□□□□ -0.878e-7■■■■■ 34.3
RPS3P23396 OAT-203ENST00000471127 751 ntTSL 27.95□□□□□ -1.143e-7■■■■■ 34.3
RPS3P23396 PLS3-202ENST00000355899 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.173e-6■■■■■ 34.3
RPS3P23396 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.533e-6■■■■■ 34.3
RPS3P23396 PLS3-206ENST00000481823 2858 ntTSL 25.4□□□□□ -1.543e-6■■■■■ 34.3
RPS3P23396 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.73e-6■■■■■ 34.3
RPS3P23396 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.83e-6■■■■■ 34.3
RPS3P23396 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.615e-7■■■■■ 34.3
RPS3P23396 LPCAT3-203ENST00000535479 2902 ntTSL 1 (best)13.29□□□□□ -0.285e-7■■■■■ 34.3
RPS3P23396 MDH1-214ENST00000495083 552 ntTSL 24.34□□□□□ -1.715e-9■■■■■ 34.2
RPS3P23396 C1orf43-209ENST00000493814 441 ntTSL 28.81□□□□□ -12e-6■■■■■ 34.2
RPS3P23396 SERPINE1-201ENST00000223095 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.695e-8■■■■■ 34.2
RPS3P23396 DCAF13-204ENST00000521716 537 ntTSL 214.68□□□□□ -0.068e-8■■■■■ 34.2
RPS3P23396 LGALS3BP-219ENST00000592255 556 ntTSL 212.08□□□□□ -0.486e-32■■■■■ 34.2
RPS3P23396 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.617e-8■■■■■ 34.2
RPS3P23396 MRPL2-203ENST00000468957 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.747e-8■■■■■ 34.2
RPS3P23396 PSMD10-202ENST00000338548 514 ntTSL 24.55□□□□□ -1.684e-7■■■■■ 34.2
RPS3P23396 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.624e-7■■■■■ 34.2
RPS3P23396 ARHGAP19-204ENST00000466484 601 ntTSL 311.89□□□□□ -0.511e-6■■■■■ 34.2
RPS3P23396 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.277e-7■■■■■ 34.1
RPS3P23396 POLR2G-202ENST00000524819 1053 ntTSL 312.75□□□□□ -0.377e-7■■■■■ 34.1
RPS3P23396 POLR2G-203ENST00000525455 919 ntTSL 312.53□□□□□ -0.47e-7■■■■■ 34.1
RPS3P23396 POLR2G-206ENST00000531944 1556 ntTSL 511.43□□□□□ -0.587e-7■■■■■ 34.1
RPS3P23396 POLR2G-205ENST00000527435 868 ntTSL 29.29□□□□□ -0.927e-7■■■■■ 34.1
RPS3P23396 SORL1-210ENST00000532451 2165 ntTSL 1 (best)23.28■■□□□ 1.323e-7■■■■■ 34.1
RPS3P23396 TUBB2A-201ENST00000333628 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.324e-6■■■■■ 34.1
RPS3P23396 ACSM3-211ENST00000567387 843 ntTSL 36.79□□□□□ -1.321e-8■■■■■ 34.1
RPS3P23396 SUCLG1-207ENST00000488234 275 ntTSL 35.03□□□□□ -1.62e-6■■■■■ 34.1
RPS3P23396 ACSM3-214ENST00000569141 405 ntTSL 50.87□□□□□ -2.271e-8■■■■■ 34.1
RPS3P23396 KISS1R-202ENST00000592648 507 ntTSL 518.11■□□□□ 0.491e-8■■■■■ 34.1
RPS3P23396 MYL12A-207ENST00000579226 947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.693e-10■■■■■ 34.1
RPS3P23396 MYL12A-206ENST00000578611 1004 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.843e-10■■■■■ 34.1
RPS3P23396 MYL12A-201ENST00000217652 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.923e-10■■■■■ 34.1
RPS3P23396 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.323e-7■■■■■ 34
RPS3P23396 RPL9-205ENST00000503277 769 ntTSL 28.78□□□□□ -13e-7■■■■■ 34
RPS3P23396 TMBIM6-226ENST00000552635 574 ntTSL 46.76□□□□□ -1.338e-9■■■■■ 34
RPS3P23396 CNBP-209ENST00000507573 641 ntTSL 212.88□□□□□ -0.356e-10■■■■■ 34
RPS3P23396 SPNS1-209ENST00000567771 829 ntTSL 324.46■■□□□ 1.512e-18■■■■■ 34
RPS3P23396 SPNS1-212ENST00000568900 2253 ntTSL 220.69■□□□□ 0.92e-18■■■■■ 34
RPS3P23396 SPNS1-210ENST00000568388 759 ntTSL 318.54■□□□□ 0.562e-18■■■■■ 34
RPS3P23396 PRMT5-210ENST00000553550 580 ntTSL 320.8■□□□□ 0.922e-6■■■■■ 33.9
RPS3P23396 PRMT5-219ENST00000555530 837 ntTSL 512.91□□□□□ -0.342e-6■■■■■ 33.9
RPS3P23396 A1BG-205ENST00000600966 917 ntTSL 517.55■□□□□ 0.49e-7■■■■■ 33.8
RPS3P23396 ARHGAP19-SLIT1-202ENST00000479633 1876 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.691e-6■■■■■ 33.8
RPS3P23396 ARHGAP19-201ENST00000358308 5390 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.911e-6■■■■■ 33.8
RPS3P23396 ARHGAP19-203ENST00000371027 2301 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.931e-6■■■■■ 33.8
RPS3P23396 ARHGAP19-202ENST00000358531 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.011e-6■■■■■ 33.8
RPS3P23396 ARHGAP19-206ENST00000492211 5525 ntTSL 28.07□□□□□ -1.121e-6■■■■■ 33.8
RPS3P23396 PSMB1-202ENST00000462957 1939 ntTSL 25.12□□□□□ -1.599e-9■■■■■ 33.8
RPS3P23396 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.221e-6■■■■■ 33.8
RPS3P23396 PLCD1-209ENST00000495395 401 ntTSL 39.47□□□□□ -0.892e-13■■■■■ 33.8
RPS3P23396 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.285e-12■■■■■ 33.8
RPS3P23396 ALDH18A1-205ENST00000489386 543 ntTSL 35.61□□□□□ -1.512e-9■■■■■ 33.7
RPS3P23396 DPY30-204ENST00000422413 601 ntTSL 316.43■□□□□ 0.221e-6■■■■■ 33.7
RPS3P23396 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.221e-6■■■■■ 33.7
RPS3P23396 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.221e-6■■■■■ 33.7
RPS3P23396 DPY30-203ENST00000414013 523 ntTSL 312.59□□□□□ -0.391e-6■■■■■ 33.7
RPS3P23396 DPY30-205ENST00000430665 524 ntTSL 512.47□□□□□ -0.411e-6■■■■■ 33.7
RPS3P23396 DPY30-207ENST00000452582 637 ntTSL 310.82□□□□□ -0.681e-6■■■■■ 33.7
RPS3P23396 TFPI-211ENST00000481132 7690 ntTSL 26.68□□□□□ -1.342e-8■■■■■ 33.7
RPS3P23396 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.722e-8■■■■■ 33.7
RPS3P23396 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.192e-23■■■■■ 33.7
RPS3P23396 ATP5G3-205ENST00000497075 1313 ntTSL 212.88□□□□□ -0.352e-23■■■■■ 33.7
RPS3P23396 ATP5G3-201ENST00000284727 5484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.832e-23■■■■■ 33.7
RPS3P23396 ATP5G3-203ENST00000409194 795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.912e-23■■■■■ 33.7
RPS3P23396 SPP1-204ENST00000504310 557 ntTSL 38.25□□□□□ -1.092e-17■■■■■ 33.7
RPS3P23396 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.448e-11■■■■■ 33.6
RPS3P23396 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.116e-7■■■■■ 33.6
RPS3P23396 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.321e-7■■■■■ 33.6
RPS3P23396 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.961e-7■■■■■ 33.6
RPS3P23396 GGA2-201ENST00000309859 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.681e-7■■■■■ 33.6
RPS3P23396 GGA2-214ENST00000569182 587 ntTSL 49.8□□□□□ -0.841e-7■■■■■ 33.6
RPS3P23396 PHGDH-231ENST00000641939 540 nt14.61□□□□□ -0.072e-12■■■■■ 33.6
RPS3P23396 RRM1-210ENST00000532170 3166 ntTSL 27.1□□□□□ -1.271e-6■■■■■ 33.6
RPS3P23396 RRM1-212ENST00000533349 2863 ntTSL 26.59□□□□□ -1.351e-6■■■■■ 33.6
RPS3P23396 RRM1-201ENST00000300738 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.481e-6■■■■■ 33.6
RPS3P23396 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.265e-12■■■■■ 33.6
RPS3P23396 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.313e-13■■■■■ 33.5
RPS3P23396 ISOC2-207ENST00000590921 2283 ntTSL 218.39■□□□□ 0.542e-6■■■■■ 33.5
RPS3P23396 AC005726.2-201ENST00000481916 2091 ntTSL 1 (best)21.05■□□□□ 0.961e-7■■■■■ 33.5
RPS3P23396 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.13e-9■■■■■ 33.5
RPS3P23396 COMT-201ENST00000207636 1319 ntTSL 514.81□□□□□ -0.043e-9■■■■■ 33.5
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