Protein–RNA interactions for Protein: P19256

CD58, Lymphocyte function-associated antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD58P19256 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CD58P19256 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CD58P19256 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CD58P19256 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CD58P19256 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CD58P19256 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CD58P19256 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CD58P19256 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CD58P19256 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CD58P19256 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CD58P19256 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CD58P19256 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CD58P19256 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CD58P19256 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CD58P19256 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CD58P19256 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CD58P19256 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CD58P19256 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CD58P19256 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CD58P19256 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CD58P19256 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CD58P19256 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CD58P19256 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CD58P19256 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CD58P19256 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CD58P19256 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CD58P19256 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CD58P19256 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CD58P19256 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CD58P19256 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CD58P19256 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CD58P19256 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CD58P19256 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CD58P19256 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CD58P19256 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CD58P19256 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CD58P19256 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CD58P19256 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CD58P19256 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CD58P19256 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD58P19256 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD58P19256 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD58P19256 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CD58P19256 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD58P19256 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD58P19256 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CD58P19256 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD58P19256 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD58P19256 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD58P19256 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD58P19256 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD58P19256 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD58P19256 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CD58P19256 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CD58P19256 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CD58P19256 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CD58P19256 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CD58P19256 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CD58P19256 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CD58P19256 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CD58P19256 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CD58P19256 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CD58P19256 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CD58P19256 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CD58P19256 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CD58P19256 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CD58P19256 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CD58P19256 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CD58P19256 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CD58P19256 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CD58P19256 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CD58P19256 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD58P19256 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD58P19256 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD58P19256 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD58P19256 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD58P19256 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD58P19256 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD58P19256 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD58P19256 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD58P19256 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD58P19256 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD58P19256 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD58P19256 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD58P19256 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD58P19256 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD58P19256 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD58P19256 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CD58P19256 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CD58P19256 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CD58P19256 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CD58P19256 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CD58P19256 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CD58P19256 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CD58P19256 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD58P19256 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD58P19256 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD58P19256 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD58P19256 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD58P19256 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms