Protein–RNA interactions for Protein: P19075

TSPAN8, Tetraspanin-8, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN8P19075 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSPAN8P19075 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSPAN8P19075 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSPAN8P19075 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TSPAN8P19075 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSPAN8P19075 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSPAN8P19075 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSPAN8P19075 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSPAN8P19075 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TSPAN8P19075 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TSPAN8P19075 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSPAN8P19075 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TSPAN8P19075 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSPAN8P19075 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSPAN8P19075 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSPAN8P19075 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TSPAN8P19075 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSPAN8P19075 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSPAN8P19075 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSPAN8P19075 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSPAN8P19075 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSPAN8P19075 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSPAN8P19075 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSPAN8P19075 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSPAN8P19075 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSPAN8P19075 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSPAN8P19075 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSPAN8P19075 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSPAN8P19075 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSPAN8P19075 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSPAN8P19075 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSPAN8P19075 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSPAN8P19075 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSPAN8P19075 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPAN8P19075 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPAN8P19075 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPAN8P19075 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPAN8P19075 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPAN8P19075 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPAN8P19075 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPAN8P19075 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPAN8P19075 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPAN8P19075 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPAN8P19075 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPAN8P19075 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPAN8P19075 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPAN8P19075 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPAN8P19075 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPAN8P19075 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPAN8P19075 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPAN8P19075 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPAN8P19075 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPAN8P19075 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPAN8P19075 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPAN8P19075 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPAN8P19075 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPAN8P19075 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPAN8P19075 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPAN8P19075 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPAN8P19075 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPAN8P19075 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPAN8P19075 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPAN8P19075 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSPAN8P19075 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSPAN8P19075 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSPAN8P19075 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSPAN8P19075 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TSPAN8P19075 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSPAN8P19075 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSPAN8P19075 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSPAN8P19075 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSPAN8P19075 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSPAN8P19075 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSPAN8P19075 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSPAN8P19075 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSPAN8P19075 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPAN8P19075 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPAN8P19075 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPAN8P19075 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPAN8P19075 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPAN8P19075 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPAN8P19075 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPAN8P19075 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPAN8P19075 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPAN8P19075 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPAN8P19075 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPAN8P19075 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPAN8P19075 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPAN8P19075 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPAN8P19075 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPAN8P19075 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPAN8P19075 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPAN8P19075 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPAN8P19075 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPAN8P19075 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPAN8P19075 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPAN8P19075 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPAN8P19075 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPAN8P19075 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPAN8P19075 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms