Protein–RNA interactions for Protein: P18206

VCL, Vinculin, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCLP18206 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VCLP18206 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VCLP18206 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VCLP18206 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VCLP18206 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VCLP18206 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VCLP18206 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VCLP18206 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VCLP18206 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VCLP18206 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VCLP18206 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VCLP18206 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VCLP18206 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VCLP18206 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VCLP18206 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VCLP18206 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VCLP18206 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VCLP18206 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VCLP18206 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VCLP18206 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VCLP18206 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VCLP18206 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VCLP18206 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VCLP18206 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VCLP18206 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VCLP18206 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VCLP18206 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VCLP18206 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VCLP18206 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VCLP18206 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VCLP18206 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VCLP18206 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
VCLP18206 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
VCLP18206 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VCLP18206 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VCLP18206 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VCLP18206 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VCLP18206 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VCLP18206 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VCLP18206 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VCLP18206 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VCLP18206 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VCLP18206 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VCLP18206 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VCLP18206 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VCLP18206 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VCLP18206 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VCLP18206 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VCLP18206 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VCLP18206 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VCLP18206 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VCLP18206 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VCLP18206 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VCLP18206 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VCLP18206 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VCLP18206 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VCLP18206 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VCLP18206 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VCLP18206 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
VCLP18206 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VCLP18206 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VCLP18206 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VCLP18206 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VCLP18206 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VCLP18206 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VCLP18206 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VCLP18206 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VCLP18206 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VCLP18206 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VCLP18206 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VCLP18206 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VCLP18206 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VCLP18206 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
VCLP18206 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VCLP18206 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VCLP18206 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VCLP18206 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VCLP18206 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VCLP18206 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VCLP18206 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VCLP18206 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VCLP18206 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VCLP18206 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VCLP18206 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VCLP18206 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VCLP18206 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
VCLP18206 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VCLP18206 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VCLP18206 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VCLP18206 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VCLP18206 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VCLP18206 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VCLP18206 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VCLP18206 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VCLP18206 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
VCLP18206 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VCLP18206 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VCLP18206 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VCLP18206 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VCLP18206 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms