Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEFHP12036 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEFHP12036 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEFHP12036 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEFHP12036 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEFHP12036 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEFHP12036 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEFHP12036 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEFHP12036 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEFHP12036 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEFHP12036 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEFHP12036 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEFHP12036 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEFHP12036 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEFHP12036 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEFHP12036 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NEFHP12036 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEFHP12036 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEFHP12036 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NEFHP12036 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEFHP12036 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEFHP12036 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NEFHP12036 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEFHP12036 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NEFHP12036 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEFHP12036 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEFHP12036 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEFHP12036 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEFHP12036 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEFHP12036 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEFHP12036 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEFHP12036 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEFHP12036 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEFHP12036 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEFHP12036 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEFHP12036 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEFHP12036 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEFHP12036 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEFHP12036 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEFHP12036 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEFHP12036 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEFHP12036 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEFHP12036 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NEFHP12036 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NEFHP12036 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEFHP12036 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEFHP12036 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEFHP12036 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEFHP12036 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEFHP12036 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEFHP12036 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEFHP12036 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEFHP12036 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEFHP12036 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEFHP12036 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEFHP12036 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEFHP12036 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEFHP12036 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEFHP12036 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEFHP12036 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEFHP12036 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEFHP12036 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEFHP12036 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NEFHP12036 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEFHP12036 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NEFHP12036 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEFHP12036 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEFHP12036 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEFHP12036 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEFHP12036 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEFHP12036 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEFHP12036 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEFHP12036 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NEFHP12036 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEFHP12036 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEFHP12036 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEFHP12036 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEFHP12036 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEFHP12036 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEFHP12036 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEFHP12036 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEFHP12036 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEFHP12036 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEFHP12036 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEFHP12036 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEFHP12036 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEFHP12036 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEFHP12036 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEFHP12036 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEFHP12036 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEFHP12036 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEFHP12036 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEFHP12036 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEFHP12036 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEFHP12036 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEFHP12036 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEFHP12036 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEFHP12036 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEFHP12036 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEFHP12036 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms