Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PGA3P0DJD8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PGA3P0DJD8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PGA3P0DJD8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PGA3P0DJD8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PGA3P0DJD8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PGA3P0DJD8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PGA3P0DJD8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PGA3P0DJD8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PGA3P0DJD8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PGA3P0DJD8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PGA3P0DJD8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PGA3P0DJD8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PGA3P0DJD8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PGA3P0DJD8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PGA3P0DJD8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PGA3P0DJD8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PGA3P0DJD8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PGA3P0DJD8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
PGA3P0DJD8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PGA3P0DJD8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PGA3P0DJD8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PGA3P0DJD8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PGA3P0DJD8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PGA3P0DJD8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PGA3P0DJD8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PGA3P0DJD8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PGA3P0DJD8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PGA3P0DJD8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PGA3P0DJD8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PGA3P0DJD8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PGA3P0DJD8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PGA3P0DJD8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PGA3P0DJD8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PGA3P0DJD8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PGA3P0DJD8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PGA3P0DJD8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PGA3P0DJD8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PGA3P0DJD8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PGA3P0DJD8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PGA3P0DJD8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PGA3P0DJD8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PGA3P0DJD8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PGA3P0DJD8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PGA3P0DJD8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PGA3P0DJD8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PGA3P0DJD8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PGA3P0DJD8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PGA3P0DJD8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PGA3P0DJD8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PGA3P0DJD8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PGA3P0DJD8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PGA3P0DJD8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PGA3P0DJD8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PGA3P0DJD8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PGA3P0DJD8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PGA3P0DJD8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PGA3P0DJD8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PGA3P0DJD8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGA3P0DJD8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGA3P0DJD8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGA3P0DJD8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGA3P0DJD8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PGA3P0DJD8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGA3P0DJD8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGA3P0DJD8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGA3P0DJD8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGA3P0DJD8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGA3P0DJD8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGA3P0DJD8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGA3P0DJD8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGA3P0DJD8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGA3P0DJD8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGA3P0DJD8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGA3P0DJD8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGA3P0DJD8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGA3P0DJD8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGA3P0DJD8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGA3P0DJD8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGA3P0DJD8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGA3P0DJD8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGA3P0DJD8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGA3P0DJD8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGA3P0DJD8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGA3P0DJD8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGA3P0DJD8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGA3P0DJD8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGA3P0DJD8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGA3P0DJD8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGA3P0DJD8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGA3P0DJD8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGA3P0DJD8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGA3P0DJD8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGA3P0DJD8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGA3P0DJD8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGA3P0DJD8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGA3P0DJD8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGA3P0DJD8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGA3P0DJD8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGA3P0DJD8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms