Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD7

PGA4, Pepsin A-4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA4P0DJD7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PGA4P0DJD7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PGA4P0DJD7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PGA4P0DJD7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PGA4P0DJD7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PGA4P0DJD7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PGA4P0DJD7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PGA4P0DJD7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PGA4P0DJD7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PGA4P0DJD7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PGA4P0DJD7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PGA4P0DJD7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
PGA4P0DJD7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PGA4P0DJD7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PGA4P0DJD7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PGA4P0DJD7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PGA4P0DJD7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PGA4P0DJD7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PGA4P0DJD7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PGA4P0DJD7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PGA4P0DJD7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PGA4P0DJD7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PGA4P0DJD7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PGA4P0DJD7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PGA4P0DJD7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PGA4P0DJD7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PGA4P0DJD7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PGA4P0DJD7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PGA4P0DJD7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PGA4P0DJD7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PGA4P0DJD7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PGA4P0DJD7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PGA4P0DJD7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PGA4P0DJD7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PGA4P0DJD7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PGA4P0DJD7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PGA4P0DJD7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PGA4P0DJD7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PGA4P0DJD7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PGA4P0DJD7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PGA4P0DJD7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PGA4P0DJD7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PGA4P0DJD7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PGA4P0DJD7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PGA4P0DJD7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PGA4P0DJD7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PGA4P0DJD7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PGA4P0DJD7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PGA4P0DJD7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PGA4P0DJD7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PGA4P0DJD7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PGA4P0DJD7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PGA4P0DJD7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PGA4P0DJD7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGA4P0DJD7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGA4P0DJD7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGA4P0DJD7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGA4P0DJD7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PGA4P0DJD7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGA4P0DJD7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGA4P0DJD7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGA4P0DJD7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGA4P0DJD7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGA4P0DJD7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGA4P0DJD7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGA4P0DJD7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGA4P0DJD7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGA4P0DJD7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGA4P0DJD7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGA4P0DJD7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGA4P0DJD7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGA4P0DJD7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGA4P0DJD7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGA4P0DJD7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGA4P0DJD7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGA4P0DJD7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGA4P0DJD7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGA4P0DJD7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGA4P0DJD7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGA4P0DJD7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGA4P0DJD7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGA4P0DJD7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGA4P0DJD7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PGA4P0DJD7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGA4P0DJD7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGA4P0DJD7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGA4P0DJD7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGA4P0DJD7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGA4P0DJD7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGA4P0DJD7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGA4P0DJD7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGA4P0DJD7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGA4P0DJD7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PGA4P0DJD7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGA4P0DJD7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGA4P0DJD7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGA4P0DJD7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGA4P0DJD7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGA4P0DJD7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGA4P0DJD7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms