Protein–RNA interactions for Protein: P08729

KRT7, Keratin, type II cytoskeletal 7, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT7P08729 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT7P08729 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT7P08729 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT7P08729 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT7P08729 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT7P08729 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT7P08729 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT7P08729 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT7P08729 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT7P08729 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT7P08729 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT7P08729 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT7P08729 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT7P08729 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT7P08729 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT7P08729 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT7P08729 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT7P08729 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT7P08729 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT7P08729 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT7P08729 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT7P08729 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT7P08729 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT7P08729 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT7P08729 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT7P08729 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT7P08729 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT7P08729 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT7P08729 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT7P08729 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT7P08729 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT7P08729 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT7P08729 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT7P08729 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT7P08729 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT7P08729 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT7P08729 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT7P08729 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT7P08729 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT7P08729 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT7P08729 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT7P08729 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT7P08729 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT7P08729 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
KRT7P08729 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
KRT7P08729 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
KRT7P08729 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT7P08729 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT7P08729 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT7P08729 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT7P08729 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT7P08729 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT7P08729 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT7P08729 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT7P08729 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT7P08729 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT7P08729 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT7P08729 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT7P08729 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT7P08729 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT7P08729 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT7P08729 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT7P08729 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT7P08729 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT7P08729 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT7P08729 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT7P08729 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT7P08729 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT7P08729 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT7P08729 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT7P08729 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT7P08729 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT7P08729 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT7P08729 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT7P08729 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT7P08729 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT7P08729 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT7P08729 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT7P08729 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT7P08729 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT7P08729 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT7P08729 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT7P08729 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT7P08729 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT7P08729 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT7P08729 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT7P08729 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT7P08729 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT7P08729 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT7P08729 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT7P08729 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT7P08729 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT7P08729 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT7P08729 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT7P08729 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT7P08729 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT7P08729 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT7P08729 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT7P08729 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT7P08729 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms