Protein–RNA interactions for Protein: O94985

CLSTN1, Calsyntenin-1, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN1O94985 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLSTN1O94985 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLSTN1O94985 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CLSTN1O94985 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLSTN1O94985 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLSTN1O94985 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLSTN1O94985 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLSTN1O94985 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLSTN1O94985 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLSTN1O94985 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLSTN1O94985 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLSTN1O94985 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLSTN1O94985 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLSTN1O94985 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLSTN1O94985 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLSTN1O94985 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLSTN1O94985 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLSTN1O94985 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLSTN1O94985 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLSTN1O94985 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLSTN1O94985 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLSTN1O94985 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLSTN1O94985 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLSTN1O94985 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLSTN1O94985 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLSTN1O94985 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLSTN1O94985 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLSTN1O94985 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLSTN1O94985 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLSTN1O94985 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CLSTN1O94985 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
CLSTN1O94985 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CLSTN1O94985 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLSTN1O94985 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLSTN1O94985 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLSTN1O94985 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLSTN1O94985 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLSTN1O94985 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLSTN1O94985 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLSTN1O94985 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLSTN1O94985 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLSTN1O94985 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLSTN1O94985 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CLSTN1O94985 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLSTN1O94985 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLSTN1O94985 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLSTN1O94985 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLSTN1O94985 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLSTN1O94985 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLSTN1O94985 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLSTN1O94985 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLSTN1O94985 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLSTN1O94985 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLSTN1O94985 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLSTN1O94985 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLSTN1O94985 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CLSTN1O94985 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLSTN1O94985 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLSTN1O94985 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLSTN1O94985 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLSTN1O94985 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLSTN1O94985 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLSTN1O94985 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLSTN1O94985 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLSTN1O94985 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLSTN1O94985 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLSTN1O94985 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLSTN1O94985 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLSTN1O94985 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLSTN1O94985 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLSTN1O94985 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLSTN1O94985 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLSTN1O94985 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLSTN1O94985 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLSTN1O94985 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLSTN1O94985 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLSTN1O94985 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLSTN1O94985 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLSTN1O94985 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLSTN1O94985 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLSTN1O94985 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLSTN1O94985 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLSTN1O94985 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLSTN1O94985 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLSTN1O94985 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLSTN1O94985 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLSTN1O94985 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLSTN1O94985 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLSTN1O94985 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLSTN1O94985 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLSTN1O94985 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CLSTN1O94985 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLSTN1O94985 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLSTN1O94985 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLSTN1O94985 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLSTN1O94985 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLSTN1O94985 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLSTN1O94985 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLSTN1O94985 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLSTN1O94985 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms