Protein–RNA interactions for Protein: O75334

PPFIA2, Liprin-alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA2O75334 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPFIA2O75334 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPFIA2O75334 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPFIA2O75334 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPFIA2O75334 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPFIA2O75334 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPFIA2O75334 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPFIA2O75334 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPFIA2O75334 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPFIA2O75334 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPFIA2O75334 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPFIA2O75334 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPFIA2O75334 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPFIA2O75334 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPFIA2O75334 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPFIA2O75334 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPFIA2O75334 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPFIA2O75334 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPFIA2O75334 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPFIA2O75334 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PPFIA2O75334 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPFIA2O75334 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PPFIA2O75334 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPFIA2O75334 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPFIA2O75334 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPFIA2O75334 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPFIA2O75334 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPFIA2O75334 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPFIA2O75334 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPFIA2O75334 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPFIA2O75334 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PPFIA2O75334 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPFIA2O75334 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPFIA2O75334 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PPFIA2O75334 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPFIA2O75334 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPFIA2O75334 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PPFIA2O75334 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PPFIA2O75334 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PPFIA2O75334 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PPFIA2O75334 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PPFIA2O75334 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PPFIA2O75334 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PPFIA2O75334 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PPFIA2O75334 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PPFIA2O75334 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPFIA2O75334 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPFIA2O75334 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPFIA2O75334 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPFIA2O75334 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPFIA2O75334 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPFIA2O75334 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PPFIA2O75334 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPFIA2O75334 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPFIA2O75334 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPFIA2O75334 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPFIA2O75334 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPFIA2O75334 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPFIA2O75334 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPFIA2O75334 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPFIA2O75334 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPFIA2O75334 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPFIA2O75334 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPFIA2O75334 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPFIA2O75334 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPFIA2O75334 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPFIA2O75334 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPFIA2O75334 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPFIA2O75334 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPFIA2O75334 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPFIA2O75334 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPFIA2O75334 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPFIA2O75334 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPFIA2O75334 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPFIA2O75334 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPFIA2O75334 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPFIA2O75334 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPFIA2O75334 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPFIA2O75334 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPFIA2O75334 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPFIA2O75334 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPFIA2O75334 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPFIA2O75334 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPFIA2O75334 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PPFIA2O75334 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPFIA2O75334 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPFIA2O75334 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPFIA2O75334 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPFIA2O75334 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPFIA2O75334 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PPFIA2O75334 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPFIA2O75334 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPFIA2O75334 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPFIA2O75334 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPFIA2O75334 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPFIA2O75334 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPFIA2O75334 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPFIA2O75334 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPFIA2O75334 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PPFIA2O75334 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms