Protein–RNA interactions for Protein: O60238

BNIP3L, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3-like, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3LO60238 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
BNIP3LO60238 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BNIP3LO60238 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BNIP3LO60238 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BNIP3LO60238 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BNIP3LO60238 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BNIP3LO60238 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BNIP3LO60238 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BNIP3LO60238 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BNIP3LO60238 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BNIP3LO60238 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BNIP3LO60238 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BNIP3LO60238 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BNIP3LO60238 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BNIP3LO60238 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BNIP3LO60238 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BNIP3LO60238 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BNIP3LO60238 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BNIP3LO60238 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BNIP3LO60238 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BNIP3LO60238 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BNIP3LO60238 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BNIP3LO60238 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BNIP3LO60238 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BNIP3LO60238 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BNIP3LO60238 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BNIP3LO60238 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BNIP3LO60238 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BNIP3LO60238 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BNIP3LO60238 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BNIP3LO60238 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BNIP3LO60238 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BNIP3LO60238 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BNIP3LO60238 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BNIP3LO60238 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BNIP3LO60238 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BNIP3LO60238 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BNIP3LO60238 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BNIP3LO60238 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BNIP3LO60238 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BNIP3LO60238 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BNIP3LO60238 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BNIP3LO60238 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BNIP3LO60238 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BNIP3LO60238 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BNIP3LO60238 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BNIP3LO60238 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BNIP3LO60238 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
BNIP3LO60238 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BNIP3LO60238 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BNIP3LO60238 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BNIP3LO60238 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BNIP3LO60238 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BNIP3LO60238 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BNIP3LO60238 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BNIP3LO60238 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BNIP3LO60238 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BNIP3LO60238 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BNIP3LO60238 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BNIP3LO60238 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BNIP3LO60238 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BNIP3LO60238 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BNIP3LO60238 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BNIP3LO60238 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BNIP3LO60238 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BNIP3LO60238 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BNIP3LO60238 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BNIP3LO60238 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
BNIP3LO60238 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BNIP3LO60238 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BNIP3LO60238 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BNIP3LO60238 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BNIP3LO60238 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
BNIP3LO60238 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BNIP3LO60238 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
BNIP3LO60238 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BNIP3LO60238 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BNIP3LO60238 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BNIP3LO60238 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BNIP3LO60238 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BNIP3LO60238 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
BNIP3LO60238 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
BNIP3LO60238 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BNIP3LO60238 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BNIP3LO60238 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BNIP3LO60238 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
BNIP3LO60238 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BNIP3LO60238 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BNIP3LO60238 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BNIP3LO60238 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BNIP3LO60238 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BNIP3LO60238 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BNIP3LO60238 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BNIP3LO60238 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BNIP3LO60238 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BNIP3LO60238 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BNIP3LO60238 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BNIP3LO60238 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BNIP3LO60238 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BNIP3LO60238 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms