Protein–RNA interactions for Protein: O43818

RRP9, U3 small nucleolar RNA-interacting protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP9O43818 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRP9O43818 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRP9O43818 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRP9O43818 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRP9O43818 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRP9O43818 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRP9O43818 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRP9O43818 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRP9O43818 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRP9O43818 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRP9O43818 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRP9O43818 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRP9O43818 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRP9O43818 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRP9O43818 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRP9O43818 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRP9O43818 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRP9O43818 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRP9O43818 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRP9O43818 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRP9O43818 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRP9O43818 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRP9O43818 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRP9O43818 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRP9O43818 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RRP9O43818 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RRP9O43818 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RRP9O43818 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RRP9O43818 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RRP9O43818 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RRP9O43818 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RRP9O43818 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RRP9O43818 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RRP9O43818 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RRP9O43818 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RRP9O43818 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RRP9O43818 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RRP9O43818 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RRP9O43818 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RRP9O43818 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RRP9O43818 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RRP9O43818 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRP9O43818 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRP9O43818 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRP9O43818 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRP9O43818 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRP9O43818 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RRP9O43818 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RRP9O43818 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RRP9O43818 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RRP9O43818 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RRP9O43818 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RRP9O43818 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RRP9O43818 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RRP9O43818 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RRP9O43818 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RRP9O43818 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRP9O43818 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRP9O43818 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRP9O43818 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRP9O43818 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRP9O43818 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRP9O43818 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRP9O43818 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRP9O43818 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRP9O43818 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRP9O43818 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRP9O43818 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRP9O43818 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRP9O43818 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RRP9O43818 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RRP9O43818 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RRP9O43818 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RRP9O43818 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RRP9O43818 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RRP9O43818 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RRP9O43818 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RRP9O43818 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RRP9O43818 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRP9O43818 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRP9O43818 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRP9O43818 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRP9O43818 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRP9O43818 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRP9O43818 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRP9O43818 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRP9O43818 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRP9O43818 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRP9O43818 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRP9O43818 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RRP9O43818 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RRP9O43818 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RRP9O43818 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RRP9O43818 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RRP9O43818 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RRP9O43818 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RRP9O43818 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RRP9O43818 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RRP9O43818 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RRP9O43818 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms