Protein–RNA interactions for Protein: O43657

TSPAN6, Tetraspanin-6, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN6O43657 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN6O43657 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN6O43657 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN6O43657 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN6O43657 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN6O43657 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN6O43657 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN6O43657 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN6O43657 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN6O43657 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN6O43657 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN6O43657 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSPAN6O43657 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSPAN6O43657 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSPAN6O43657 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSPAN6O43657 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSPAN6O43657 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSPAN6O43657 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TSPAN6O43657 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSPAN6O43657 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSPAN6O43657 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSPAN6O43657 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSPAN6O43657 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TSPAN6O43657 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSPAN6O43657 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSPAN6O43657 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSPAN6O43657 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSPAN6O43657 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSPAN6O43657 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSPAN6O43657 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSPAN6O43657 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSPAN6O43657 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSPAN6O43657 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSPAN6O43657 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSPAN6O43657 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSPAN6O43657 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSPAN6O43657 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TSPAN6O43657 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSPAN6O43657 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSPAN6O43657 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSPAN6O43657 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TSPAN6O43657 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSPAN6O43657 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSPAN6O43657 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSPAN6O43657 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSPAN6O43657 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSPAN6O43657 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSPAN6O43657 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSPAN6O43657 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSPAN6O43657 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TSPAN6O43657 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSPAN6O43657 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSPAN6O43657 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSPAN6O43657 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSPAN6O43657 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSPAN6O43657 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSPAN6O43657 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSPAN6O43657 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSPAN6O43657 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSPAN6O43657 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSPAN6O43657 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSPAN6O43657 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSPAN6O43657 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSPAN6O43657 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSPAN6O43657 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSPAN6O43657 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSPAN6O43657 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSPAN6O43657 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSPAN6O43657 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSPAN6O43657 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSPAN6O43657 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TSPAN6O43657 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSPAN6O43657 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSPAN6O43657 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSPAN6O43657 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSPAN6O43657 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSPAN6O43657 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TSPAN6O43657 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TSPAN6O43657 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSPAN6O43657 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSPAN6O43657 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSPAN6O43657 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSPAN6O43657 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN6O43657 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN6O43657 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN6O43657 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN6O43657 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN6O43657 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN6O43657 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN6O43657 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN6O43657 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN6O43657 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN6O43657 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPAN6O43657 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPAN6O43657 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPAN6O43657 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPAN6O43657 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPAN6O43657 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPAN6O43657 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSPAN6O43657 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms