Protein–RNA interactions for Protein: O43242

PSMD3, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD3O43242 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMD3O43242 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMD3O43242 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMD3O43242 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMD3O43242 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMD3O43242 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PSMD3O43242 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMD3O43242 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMD3O43242 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMD3O43242 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMD3O43242 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMD3O43242 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMD3O43242 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMD3O43242 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMD3O43242 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMD3O43242 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMD3O43242 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMD3O43242 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMD3O43242 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMD3O43242 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMD3O43242 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMD3O43242 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMD3O43242 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMD3O43242 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMD3O43242 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMD3O43242 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMD3O43242 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMD3O43242 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMD3O43242 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMD3O43242 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMD3O43242 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMD3O43242 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMD3O43242 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMD3O43242 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMD3O43242 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMD3O43242 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMD3O43242 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMD3O43242 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMD3O43242 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMD3O43242 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMD3O43242 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMD3O43242 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMD3O43242 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMD3O43242 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMD3O43242 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMD3O43242 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMD3O43242 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMD3O43242 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMD3O43242 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMD3O43242 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMD3O43242 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMD3O43242 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMD3O43242 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMD3O43242 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMD3O43242 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMD3O43242 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMD3O43242 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMD3O43242 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMD3O43242 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMD3O43242 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMD3O43242 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMD3O43242 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMD3O43242 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMD3O43242 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMD3O43242 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMD3O43242 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMD3O43242 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMD3O43242 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMD3O43242 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMD3O43242 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMD3O43242 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMD3O43242 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMD3O43242 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMD3O43242 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMD3O43242 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMD3O43242 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PSMD3O43242 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSMD3O43242 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSMD3O43242 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSMD3O43242 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PSMD3O43242 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PSMD3O43242 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PSMD3O43242 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PSMD3O43242 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PSMD3O43242 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PSMD3O43242 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PSMD3O43242 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMD3O43242 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMD3O43242 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMD3O43242 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMD3O43242 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMD3O43242 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMD3O43242 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMD3O43242 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMD3O43242 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMD3O43242 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMD3O43242 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMD3O43242 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMD3O43242 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMD3O43242 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms