Protein–RNA interactions for Protein: O15544

LINC01565, Protein GR6, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01565O15544 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LINC01565O15544 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LINC01565O15544 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LINC01565O15544 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LINC01565O15544 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LINC01565O15544 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LINC01565O15544 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LINC01565O15544 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LINC01565O15544 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LINC01565O15544 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LINC01565O15544 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LINC01565O15544 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LINC01565O15544 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LINC01565O15544 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LINC01565O15544 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LINC01565O15544 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LINC01565O15544 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LINC01565O15544 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LINC01565O15544 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LINC01565O15544 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LINC01565O15544 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LINC01565O15544 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LINC01565O15544 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LINC01565O15544 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LINC01565O15544 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LINC01565O15544 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LINC01565O15544 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LINC01565O15544 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LINC01565O15544 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LINC01565O15544 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LINC01565O15544 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LINC01565O15544 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LINC01565O15544 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LINC01565O15544 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LINC01565O15544 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LINC01565O15544 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LINC01565O15544 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LINC01565O15544 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LINC01565O15544 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINC01565O15544 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINC01565O15544 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINC01565O15544 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINC01565O15544 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINC01565O15544 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINC01565O15544 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINC01565O15544 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINC01565O15544 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LINC01565O15544 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LINC01565O15544 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LINC01565O15544 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
LINC01565O15544 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
LINC01565O15544 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
LINC01565O15544 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
LINC01565O15544 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LINC01565O15544 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LINC01565O15544 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LINC01565O15544 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LINC01565O15544 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LINC01565O15544 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LINC01565O15544 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LINC01565O15544 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LINC01565O15544 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LINC01565O15544 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LINC01565O15544 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LINC01565O15544 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LINC01565O15544 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LINC01565O15544 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LINC01565O15544 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LINC01565O15544 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LINC01565O15544 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LINC01565O15544 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LINC01565O15544 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LINC01565O15544 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LINC01565O15544 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LINC01565O15544 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LINC01565O15544 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LINC01565O15544 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
LINC01565O15544 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LINC01565O15544 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LINC01565O15544 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LINC01565O15544 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LINC01565O15544 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LINC01565O15544 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LINC01565O15544 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LINC01565O15544 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LINC01565O15544 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LINC01565O15544 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LINC01565O15544 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC01565O15544 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC01565O15544 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC01565O15544 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC01565O15544 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC01565O15544 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC01565O15544 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC01565O15544 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC01565O15544 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC01565O15544 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LINC01565O15544 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
LINC01565O15544 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
LINC01565O15544 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms