Protein–RNA interactions for Protein: O15111

CHUK, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHUKO15111 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHUKO15111 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHUKO15111 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHUKO15111 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHUKO15111 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHUKO15111 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CHUKO15111 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHUKO15111 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHUKO15111 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHUKO15111 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHUKO15111 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHUKO15111 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHUKO15111 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHUKO15111 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHUKO15111 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CHUKO15111 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHUKO15111 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHUKO15111 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHUKO15111 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHUKO15111 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHUKO15111 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHUKO15111 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHUKO15111 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHUKO15111 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHUKO15111 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHUKO15111 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CHUKO15111 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHUKO15111 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHUKO15111 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHUKO15111 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHUKO15111 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHUKO15111 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CHUKO15111 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHUKO15111 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHUKO15111 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHUKO15111 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHUKO15111 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHUKO15111 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHUKO15111 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHUKO15111 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHUKO15111 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHUKO15111 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHUKO15111 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHUKO15111 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHUKO15111 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHUKO15111 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHUKO15111 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHUKO15111 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHUKO15111 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHUKO15111 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHUKO15111 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHUKO15111 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHUKO15111 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHUKO15111 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHUKO15111 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHUKO15111 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CHUKO15111 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHUKO15111 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHUKO15111 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHUKO15111 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHUKO15111 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CHUKO15111 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHUKO15111 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CHUKO15111 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHUKO15111 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHUKO15111 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHUKO15111 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHUKO15111 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHUKO15111 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHUKO15111 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHUKO15111 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHUKO15111 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CHUKO15111 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHUKO15111 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CHUKO15111 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CHUKO15111 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHUKO15111 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHUKO15111 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHUKO15111 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHUKO15111 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHUKO15111 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHUKO15111 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHUKO15111 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHUKO15111 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHUKO15111 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHUKO15111 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CHUKO15111 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHUKO15111 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHUKO15111 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHUKO15111 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHUKO15111 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHUKO15111 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHUKO15111 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHUKO15111 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHUKO15111 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHUKO15111 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CHUKO15111 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHUKO15111 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHUKO15111 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHUKO15111 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms