Protein–RNA interactions for Protein: O14530

TXNDC9, Thioredoxin domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC9O14530 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TXNDC9O14530 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TXNDC9O14530 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TXNDC9O14530 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TXNDC9O14530 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TXNDC9O14530 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TXNDC9O14530 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TXNDC9O14530 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TXNDC9O14530 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TXNDC9O14530 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TXNDC9O14530 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TXNDC9O14530 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TXNDC9O14530 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TXNDC9O14530 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TXNDC9O14530 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TXNDC9O14530 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TXNDC9O14530 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TXNDC9O14530 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TXNDC9O14530 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TXNDC9O14530 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TXNDC9O14530 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TXNDC9O14530 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TXNDC9O14530 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TXNDC9O14530 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TXNDC9O14530 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TXNDC9O14530 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TXNDC9O14530 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TXNDC9O14530 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TXNDC9O14530 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TXNDC9O14530 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TXNDC9O14530 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TXNDC9O14530 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TXNDC9O14530 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TXNDC9O14530 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TXNDC9O14530 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TXNDC9O14530 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TXNDC9O14530 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TXNDC9O14530 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TXNDC9O14530 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TXNDC9O14530 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TXNDC9O14530 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TXNDC9O14530 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TXNDC9O14530 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TXNDC9O14530 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TXNDC9O14530 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TXNDC9O14530 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TXNDC9O14530 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TXNDC9O14530 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TXNDC9O14530 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TXNDC9O14530 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TXNDC9O14530 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TXNDC9O14530 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TXNDC9O14530 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TXNDC9O14530 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TXNDC9O14530 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TXNDC9O14530 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TXNDC9O14530 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TXNDC9O14530 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TXNDC9O14530 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TXNDC9O14530 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TXNDC9O14530 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TXNDC9O14530 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TXNDC9O14530 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TXNDC9O14530 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TXNDC9O14530 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TXNDC9O14530 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TXNDC9O14530 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TXNDC9O14530 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TXNDC9O14530 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TXNDC9O14530 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TXNDC9O14530 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TXNDC9O14530 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TXNDC9O14530 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TXNDC9O14530 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TXNDC9O14530 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TXNDC9O14530 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TXNDC9O14530 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TXNDC9O14530 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TXNDC9O14530 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TXNDC9O14530 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TXNDC9O14530 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TXNDC9O14530 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TXNDC9O14530 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TXNDC9O14530 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TXNDC9O14530 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TXNDC9O14530 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TXNDC9O14530 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TXNDC9O14530 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TXNDC9O14530 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TXNDC9O14530 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TXNDC9O14530 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TXNDC9O14530 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TXNDC9O14530 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TXNDC9O14530 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TXNDC9O14530 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TXNDC9O14530 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TXNDC9O14530 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TXNDC9O14530 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TXNDC9O14530 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TXNDC9O14530 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms