Protein–RNA interactions for Protein: O00148

DDX39A, ATP-dependent RNA helicase DDX39A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39AO00148 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDX39AO00148 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDX39AO00148 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDX39AO00148 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDX39AO00148 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDX39AO00148 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDX39AO00148 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
DDX39AO00148 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
DDX39AO00148 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
DDX39AO00148 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
DDX39AO00148 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
DDX39AO00148 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
DDX39AO00148 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
DDX39AO00148 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DDX39AO00148 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DDX39AO00148 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDX39AO00148 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDX39AO00148 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
DDX39AO00148 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DDX39AO00148 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DDX39AO00148 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DDX39AO00148 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DDX39AO00148 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
DDX39AO00148 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DDX39AO00148 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
DDX39AO00148 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
DDX39AO00148 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDX39AO00148 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDX39AO00148 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDX39AO00148 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDX39AO00148 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDX39AO00148 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDX39AO00148 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDX39AO00148 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDX39AO00148 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDX39AO00148 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDX39AO00148 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DDX39AO00148 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DDX39AO00148 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DDX39AO00148 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DDX39AO00148 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DDX39AO00148 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DDX39AO00148 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DDX39AO00148 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DDX39AO00148 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DDX39AO00148 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DDX39AO00148 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DDX39AO00148 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DDX39AO00148 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DDX39AO00148 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DDX39AO00148 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DDX39AO00148 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DDX39AO00148 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
DDX39AO00148 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
DDX39AO00148 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDX39AO00148 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDX39AO00148 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
DDX39AO00148 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDX39AO00148 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDX39AO00148 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDX39AO00148 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDX39AO00148 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDX39AO00148 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDX39AO00148 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDX39AO00148 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDX39AO00148 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDX39AO00148 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDX39AO00148 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDX39AO00148 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDX39AO00148 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDX39AO00148 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDX39AO00148 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDX39AO00148 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDX39AO00148 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDX39AO00148 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
DDX39AO00148 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDX39AO00148 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDX39AO00148 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDX39AO00148 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDX39AO00148 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDX39AO00148 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
DDX39AO00148 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDX39AO00148 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDX39AO00148 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDX39AO00148 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDX39AO00148 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDX39AO00148 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDX39AO00148 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDX39AO00148 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDX39AO00148 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDX39AO00148 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDX39AO00148 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDX39AO00148 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDX39AO00148 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDX39AO00148 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDX39AO00148 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDX39AO00148 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDX39AO00148 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDX39AO00148 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDX39AO00148 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms