Protein–RNA interactions for Protein: E9PRG8

C11orf98, Uncharacterized protein C11orf98, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf98E9PRG8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C11orf98E9PRG8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C11orf98E9PRG8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C11orf98E9PRG8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C11orf98E9PRG8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C11orf98E9PRG8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C11orf98E9PRG8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C11orf98E9PRG8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C11orf98E9PRG8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C11orf98E9PRG8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C11orf98E9PRG8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C11orf98E9PRG8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
C11orf98E9PRG8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C11orf98E9PRG8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C11orf98E9PRG8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C11orf98E9PRG8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C11orf98E9PRG8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C11orf98E9PRG8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C11orf98E9PRG8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C11orf98E9PRG8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C11orf98E9PRG8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C11orf98E9PRG8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C11orf98E9PRG8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C11orf98E9PRG8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C11orf98E9PRG8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C11orf98E9PRG8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C11orf98E9PRG8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C11orf98E9PRG8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C11orf98E9PRG8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C11orf98E9PRG8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C11orf98E9PRG8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C11orf98E9PRG8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C11orf98E9PRG8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C11orf98E9PRG8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C11orf98E9PRG8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C11orf98E9PRG8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C11orf98E9PRG8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C11orf98E9PRG8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C11orf98E9PRG8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C11orf98E9PRG8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C11orf98E9PRG8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C11orf98E9PRG8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C11orf98E9PRG8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C11orf98E9PRG8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C11orf98E9PRG8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C11orf98E9PRG8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C11orf98E9PRG8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C11orf98E9PRG8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C11orf98E9PRG8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C11orf98E9PRG8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
C11orf98E9PRG8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C11orf98E9PRG8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C11orf98E9PRG8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C11orf98E9PRG8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C11orf98E9PRG8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C11orf98E9PRG8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C11orf98E9PRG8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C11orf98E9PRG8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C11orf98E9PRG8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
C11orf98E9PRG8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
C11orf98E9PRG8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C11orf98E9PRG8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C11orf98E9PRG8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C11orf98E9PRG8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C11orf98E9PRG8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C11orf98E9PRG8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C11orf98E9PRG8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C11orf98E9PRG8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C11orf98E9PRG8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C11orf98E9PRG8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C11orf98E9PRG8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C11orf98E9PRG8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C11orf98E9PRG8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C11orf98E9PRG8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C11orf98E9PRG8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C11orf98E9PRG8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C11orf98E9PRG8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C11orf98E9PRG8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C11orf98E9PRG8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C11orf98E9PRG8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C11orf98E9PRG8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C11orf98E9PRG8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C11orf98E9PRG8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C11orf98E9PRG8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C11orf98E9PRG8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C11orf98E9PRG8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C11orf98E9PRG8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C11orf98E9PRG8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C11orf98E9PRG8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
C11orf98E9PRG8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C11orf98E9PRG8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C11orf98E9PRG8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C11orf98E9PRG8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C11orf98E9PRG8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C11orf98E9PRG8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C11orf98E9PRG8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C11orf98E9PRG8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C11orf98E9PRG8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C11orf98E9PRG8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C11orf98E9PRG8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.4 ms