Protein–RNA interactions for Protein: B1AKI9

ISM1, Isthmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISM1B1AKI9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ISM1B1AKI9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ISM1B1AKI9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ISM1B1AKI9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ISM1B1AKI9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ISM1B1AKI9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ISM1B1AKI9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ISM1B1AKI9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ISM1B1AKI9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ISM1B1AKI9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ISM1B1AKI9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ISM1B1AKI9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ISM1B1AKI9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ISM1B1AKI9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ISM1B1AKI9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ISM1B1AKI9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ISM1B1AKI9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ISM1B1AKI9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ISM1B1AKI9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ISM1B1AKI9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ISM1B1AKI9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ISM1B1AKI9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ISM1B1AKI9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ISM1B1AKI9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ISM1B1AKI9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ISM1B1AKI9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ISM1B1AKI9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ISM1B1AKI9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ISM1B1AKI9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ISM1B1AKI9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ISM1B1AKI9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ISM1B1AKI9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ISM1B1AKI9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ISM1B1AKI9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ISM1B1AKI9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ISM1B1AKI9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ISM1B1AKI9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ISM1B1AKI9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ISM1B1AKI9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ISM1B1AKI9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ISM1B1AKI9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ISM1B1AKI9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ISM1B1AKI9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ISM1B1AKI9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ISM1B1AKI9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ISM1B1AKI9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ISM1B1AKI9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ISM1B1AKI9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ISM1B1AKI9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ISM1B1AKI9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ISM1B1AKI9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ISM1B1AKI9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ISM1B1AKI9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ISM1B1AKI9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ISM1B1AKI9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ISM1B1AKI9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ISM1B1AKI9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ISM1B1AKI9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ISM1B1AKI9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ISM1B1AKI9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ISM1B1AKI9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ISM1B1AKI9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ISM1B1AKI9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ISM1B1AKI9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ISM1B1AKI9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ISM1B1AKI9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ISM1B1AKI9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ISM1B1AKI9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ISM1B1AKI9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ISM1B1AKI9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ISM1B1AKI9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ISM1B1AKI9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ISM1B1AKI9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ISM1B1AKI9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ISM1B1AKI9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ISM1B1AKI9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ISM1B1AKI9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ISM1B1AKI9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ISM1B1AKI9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ISM1B1AKI9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ISM1B1AKI9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ISM1B1AKI9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ISM1B1AKI9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ISM1B1AKI9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ISM1B1AKI9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ISM1B1AKI9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ISM1B1AKI9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ISM1B1AKI9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ISM1B1AKI9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ISM1B1AKI9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ISM1B1AKI9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ISM1B1AKI9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ISM1B1AKI9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ISM1B1AKI9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ISM1B1AKI9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ISM1B1AKI9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ISM1B1AKI9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ISM1B1AKI9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ISM1B1AKI9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ISM1B1AKI9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms