Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC169A6NNP5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC169A6NNP5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC169A6NNP5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC169A6NNP5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC169A6NNP5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC169A6NNP5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC169A6NNP5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC169A6NNP5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC169A6NNP5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC169A6NNP5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC169A6NNP5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC169A6NNP5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC169A6NNP5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC169A6NNP5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC169A6NNP5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC169A6NNP5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC169A6NNP5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC169A6NNP5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC169A6NNP5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC169A6NNP5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC169A6NNP5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC169A6NNP5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC169A6NNP5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC169A6NNP5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC169A6NNP5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC169A6NNP5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC169A6NNP5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC169A6NNP5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC169A6NNP5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC169A6NNP5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC169A6NNP5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC169A6NNP5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC169A6NNP5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC169A6NNP5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC169A6NNP5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC169A6NNP5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC169A6NNP5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC169A6NNP5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC169A6NNP5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC169A6NNP5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC169A6NNP5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC169A6NNP5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC169A6NNP5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC169A6NNP5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC169A6NNP5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC169A6NNP5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC169A6NNP5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC169A6NNP5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC169A6NNP5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC169A6NNP5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC169A6NNP5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC169A6NNP5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC169A6NNP5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC169A6NNP5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC169A6NNP5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC169A6NNP5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC169A6NNP5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC169A6NNP5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC169A6NNP5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC169A6NNP5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC169A6NNP5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC169A6NNP5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC169A6NNP5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC169A6NNP5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC169A6NNP5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC169A6NNP5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC169A6NNP5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC169A6NNP5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC169A6NNP5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC169A6NNP5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC169A6NNP5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC169A6NNP5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC169A6NNP5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC169A6NNP5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC169A6NNP5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC169A6NNP5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC169A6NNP5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC169A6NNP5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC169A6NNP5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC169A6NNP5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC169A6NNP5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC169A6NNP5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC169A6NNP5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC169A6NNP5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC169A6NNP5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC169A6NNP5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC169A6NNP5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC169A6NNP5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC169A6NNP5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC169A6NNP5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC169A6NNP5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC169A6NNP5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC169A6NNP5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC169A6NNP5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC169A6NNP5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC169A6NNP5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC169A6NNP5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC169A6NNP5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC169A6NNP5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms