Protein–RNA interactions for Protein: A6NH11

GLTPD2, Glycolipid transfer protein domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLTPD2A6NH11 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GLTPD2A6NH11 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GLTPD2A6NH11 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GLTPD2A6NH11 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GLTPD2A6NH11 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GLTPD2A6NH11 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GLTPD2A6NH11 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GLTPD2A6NH11 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GLTPD2A6NH11 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GLTPD2A6NH11 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GLTPD2A6NH11 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GLTPD2A6NH11 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GLTPD2A6NH11 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GLTPD2A6NH11 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
GLTPD2A6NH11 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GLTPD2A6NH11 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GLTPD2A6NH11 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GLTPD2A6NH11 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GLTPD2A6NH11 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GLTPD2A6NH11 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GLTPD2A6NH11 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GLTPD2A6NH11 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GLTPD2A6NH11 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
GLTPD2A6NH11 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GLTPD2A6NH11 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
GLTPD2A6NH11 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
GLTPD2A6NH11 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
GLTPD2A6NH11 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GLTPD2A6NH11 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GLTPD2A6NH11 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
GLTPD2A6NH11 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GLTPD2A6NH11 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GLTPD2A6NH11 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GLTPD2A6NH11 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GLTPD2A6NH11 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GLTPD2A6NH11 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GLTPD2A6NH11 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GLTPD2A6NH11 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GLTPD2A6NH11 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GLTPD2A6NH11 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GLTPD2A6NH11 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GLTPD2A6NH11 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GLTPD2A6NH11 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GLTPD2A6NH11 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GLTPD2A6NH11 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GLTPD2A6NH11 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GLTPD2A6NH11 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GLTPD2A6NH11 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GLTPD2A6NH11 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GLTPD2A6NH11 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GLTPD2A6NH11 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GLTPD2A6NH11 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GLTPD2A6NH11 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GLTPD2A6NH11 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GLTPD2A6NH11 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
GLTPD2A6NH11 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
GLTPD2A6NH11 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GLTPD2A6NH11 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GLTPD2A6NH11 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
GLTPD2A6NH11 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GLTPD2A6NH11 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GLTPD2A6NH11 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GLTPD2A6NH11 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GLTPD2A6NH11 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GLTPD2A6NH11 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GLTPD2A6NH11 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GLTPD2A6NH11 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GLTPD2A6NH11 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
GLTPD2A6NH11 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GLTPD2A6NH11 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GLTPD2A6NH11 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GLTPD2A6NH11 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GLTPD2A6NH11 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GLTPD2A6NH11 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
GLTPD2A6NH11 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GLTPD2A6NH11 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GLTPD2A6NH11 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GLTPD2A6NH11 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GLTPD2A6NH11 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GLTPD2A6NH11 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GLTPD2A6NH11 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GLTPD2A6NH11 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GLTPD2A6NH11 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GLTPD2A6NH11 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GLTPD2A6NH11 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GLTPD2A6NH11 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
GLTPD2A6NH11 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GLTPD2A6NH11 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GLTPD2A6NH11 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GLTPD2A6NH11 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GLTPD2A6NH11 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GLTPD2A6NH11 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GLTPD2A6NH11 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GLTPD2A6NH11 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GLTPD2A6NH11 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GLTPD2A6NH11 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GLTPD2A6NH11 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GLTPD2A6NH11 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GLTPD2A6NH11 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GLTPD2A6NH11 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms