Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
ZNF316A6NFI3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
ZNF316A6NFI3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
ZNF316A6NFI3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
ZNF316A6NFI3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
ZNF316A6NFI3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
ZNF316A6NFI3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
ZNF316A6NFI3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
ZNF316A6NFI3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
ZNF316A6NFI3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
ZNF316A6NFI3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
ZNF316A6NFI3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
ZNF316A6NFI3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
ZNF316A6NFI3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
ZNF316A6NFI3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
ZNF316A6NFI3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
ZNF316A6NFI3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
ZNF316A6NFI3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
ZNF316A6NFI3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
ZNF316A6NFI3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
ZNF316A6NFI3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
ZNF316A6NFI3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
ZNF316A6NFI3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
ZNF316A6NFI3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
ZNF316A6NFI3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
ZNF316A6NFI3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
ZNF316A6NFI3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
ZNF316A6NFI3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
ZNF316A6NFI3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
ZNF316A6NFI3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
ZNF316A6NFI3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
ZNF316A6NFI3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
ZNF316A6NFI3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
ZNF316A6NFI3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
ZNF316A6NFI3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC32.44■■■□□ 2.78
ZNF316A6NFI3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
ZNF316A6NFI3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
ZNF316A6NFI3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
ZNF316A6NFI3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
ZNF316A6NFI3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
ZNF316A6NFI3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
ZNF316A6NFI3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
ZNF316A6NFI3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
ZNF316A6NFI3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
ZNF316A6NFI3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
ZNF316A6NFI3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
ZNF316A6NFI3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
ZNF316A6NFI3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
ZNF316A6NFI3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
ZNF316A6NFI3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
ZNF316A6NFI3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
ZNF316A6NFI3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
ZNF316A6NFI3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
ZNF316A6NFI3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
ZNF316A6NFI3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
ZNF316A6NFI3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
ZNF316A6NFI3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
ZNF316A6NFI3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
ZNF316A6NFI3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
ZNF316A6NFI3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
ZNF316A6NFI3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
ZNF316A6NFI3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
ZNF316A6NFI3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
ZNF316A6NFI3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
ZNF316A6NFI3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
ZNF316A6NFI3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
ZNF316A6NFI3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
ZNF316A6NFI3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
ZNF316A6NFI3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
ZNF316A6NFI3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
ZNF316A6NFI3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
ZNF316A6NFI3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
ZNF316A6NFI3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
ZNF316A6NFI3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
ZNF316A6NFI3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
ZNF316A6NFI3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
ZNF316A6NFI3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
ZNF316A6NFI3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
ZNF316A6NFI3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
ZNF316A6NFI3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
ZNF316A6NFI3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
ZNF316A6NFI3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
ZNF316A6NFI3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
ZNF316A6NFI3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
ZNF316A6NFI3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
ZNF316A6NFI3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
ZNF316A6NFI3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
ZNF316A6NFI3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
ZNF316A6NFI3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
ZNF316A6NFI3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
ZNF316A6NFI3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
ZNF316A6NFI3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
ZNF316A6NFI3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
ZNF316A6NFI3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
ZNF316A6NFI3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
ZNF316A6NFI3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
ZNF316A6NFI3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
ZNF316A6NFI3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
ZNF316A6NFI3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
ZNF316A6NFI3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms