Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
COPS3Q9UNS2 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
COPS3Q9UNS2 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
COPS3Q9UNS2 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
COPS3Q9UNS2 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
COPS3Q9UNS2 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
COPS3Q9UNS2 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
COPS3Q9UNS2 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
COPS3Q9UNS2 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
COPS3Q9UNS2 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
COPS3Q9UNS2 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
COPS3Q9UNS2 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
COPS3Q9UNS2 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
COPS3Q9UNS2 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
COPS3Q9UNS2 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
COPS3Q9UNS2 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
COPS3Q9UNS2 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
COPS3Q9UNS2 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
COPS3Q9UNS2 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
COPS3Q9UNS2 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
COPS3Q9UNS2 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
COPS3Q9UNS2 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
COPS3Q9UNS2 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
COPS3Q9UNS2 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
COPS3Q9UNS2 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
COPS3Q9UNS2 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
COPS3Q9UNS2 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
COPS3Q9UNS2 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
COPS3Q9UNS2 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
COPS3Q9UNS2 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
COPS3Q9UNS2 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
COPS3Q9UNS2 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
COPS3Q9UNS2 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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COPS3Q9UNS2 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
COPS3Q9UNS2 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
COPS3Q9UNS2 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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COPS3Q9UNS2 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
COPS3Q9UNS2 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
COPS3Q9UNS2 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
COPS3Q9UNS2 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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COPS3Q9UNS2 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
COPS3Q9UNS2 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
COPS3Q9UNS2 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
COPS3Q9UNS2 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
COPS3Q9UNS2 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
COPS3Q9UNS2 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
COPS3Q9UNS2 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
COPS3Q9UNS2 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
COPS3Q9UNS2 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
COPS3Q9UNS2 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
COPS3Q9UNS2 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
COPS3Q9UNS2 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
COPS3Q9UNS2 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
COPS3Q9UNS2 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
COPS3Q9UNS2 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
COPS3Q9UNS2 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
COPS3Q9UNS2 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
COPS3Q9UNS2 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
COPS3Q9UNS2 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
COPS3Q9UNS2 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
COPS3Q9UNS2 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
COPS3Q9UNS2 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
COPS3Q9UNS2 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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