Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT67

NDFIP1, NEDD4 family-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP1Q9BT67 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 CAD-201ENST00000264705 7265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 BCL2L13-214ENST00000543133 4975 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 BCL2L13-217ENST00000618481 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 COL3A1-201ENST00000304636 5543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 BRD1-201ENST00000216267 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 PAAF1-201ENST00000310571 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 MEF2D-204ENST00000464356 5598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 IST1-203ENST00000378799 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 PERP-201ENST00000421351 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 BDNF-208ENST00000418212 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 DGCR5-203ENST00000438934 5492 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 SRC-204ENST00000373578 4630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 RBM33-203ENST00000341148 7058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NDFIP1Q9BT67 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms