Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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