Protein–RNA interactions for Protein: Q96M63

CCDC114, Coiled-coil domain-containing protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC114Q96M63 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC114Q96M63 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC114Q96M63 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC114Q96M63 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC114Q96M63 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC114Q96M63 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC114Q96M63 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC114Q96M63 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC114Q96M63 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC114Q96M63 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC114Q96M63 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC114Q96M63 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC114Q96M63 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC114Q96M63 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC114Q96M63 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC114Q96M63 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC114Q96M63 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC114Q96M63 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC114Q96M63 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC114Q96M63 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC114Q96M63 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC114Q96M63 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC114Q96M63 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC114Q96M63 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC114Q96M63 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC114Q96M63 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC114Q96M63 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC114Q96M63 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC114Q96M63 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC114Q96M63 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC114Q96M63 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC114Q96M63 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC114Q96M63 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC114Q96M63 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC114Q96M63 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC114Q96M63 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC114Q96M63 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC114Q96M63 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC114Q96M63 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC114Q96M63 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC114Q96M63 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC114Q96M63 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC114Q96M63 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC114Q96M63 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC114Q96M63 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC114Q96M63 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC114Q96M63 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC114Q96M63 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC114Q96M63 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC114Q96M63 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC114Q96M63 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC114Q96M63 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC114Q96M63 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC114Q96M63 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC114Q96M63 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC114Q96M63 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC114Q96M63 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC114Q96M63 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC114Q96M63 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC114Q96M63 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC114Q96M63 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC114Q96M63 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC114Q96M63 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC114Q96M63 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC114Q96M63 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC114Q96M63 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC114Q96M63 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC114Q96M63 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC114Q96M63 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC114Q96M63 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC114Q96M63 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC114Q96M63 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC114Q96M63 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC114Q96M63 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC114Q96M63 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC114Q96M63 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC114Q96M63 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC114Q96M63 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC114Q96M63 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC114Q96M63 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC114Q96M63 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC114Q96M63 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC114Q96M63 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC114Q96M63 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC114Q96M63 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC114Q96M63 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC114Q96M63 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC114Q96M63 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC114Q96M63 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC114Q96M63 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC114Q96M63 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC114Q96M63 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC114Q96M63 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC114Q96M63 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC114Q96M63 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC114Q96M63 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC114Q96M63 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC114Q96M63 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC114Q96M63 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC114Q96M63 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms