Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 AL645608.7-201ENST00000607769 351 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC27A3Q5K4L6 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC27A3Q5K4L6 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC27A3Q5K4L6 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC27A3Q5K4L6 HTR3D-201ENST00000334128 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC27A3Q5K4L6 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC27A3Q5K4L6 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC27A3Q5K4L6 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC27A3Q5K4L6 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC27A3Q5K4L6 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC27A3Q5K4L6 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC27A3Q5K4L6 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC27A3Q5K4L6 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC27A3Q5K4L6 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC27A3Q5K4L6 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC27A3Q5K4L6 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC27A3Q5K4L6 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC27A3Q5K4L6 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC27A3Q5K4L6 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC27A3Q5K4L6 SNX15-201ENST00000352068 771 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC27A3Q5K4L6 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC27A3Q5K4L6 AQP7-202ENST00000377425 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC27A3Q5K4L6 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC27A3Q5K4L6 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC27A3Q5K4L6 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC27A3Q5K4L6 AC114812.1-201ENST00000421868 689 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC27A3Q5K4L6 AC027612.2-202ENST00000445955 1199 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC27A3Q5K4L6 AC015795.2-201ENST00000512720 575 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC27A3Q5K4L6 IKBKB-223ENST00000522147 954 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC27A3Q5K4L6 RBM4-211ENST00000530235 1011 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC27A3Q5K4L6 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC27A3Q5K4L6 MCM8-AS1-201ENST00000613522 983 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC27A3Q5K4L6 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC27A3Q5K4L6 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC27A3Q5K4L6 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC27A3Q5K4L6 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC27A3Q5K4L6 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC27A3Q5K4L6 COLQ-202ENST00000383786 1482 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC27A3Q5K4L6 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC27A3Q5K4L6 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC27A3Q5K4L6 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC27A3Q5K4L6 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC27A3Q5K4L6 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC27A3Q5K4L6 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC27A3Q5K4L6 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC27A3Q5K4L6 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC27A3Q5K4L6 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC27A3Q5K4L6 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC27A3Q5K4L6 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC27A3Q5K4L6 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC27A3Q5K4L6 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC27A3Q5K4L6 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC27A3Q5K4L6 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC27A3Q5K4L6 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC27A3Q5K4L6 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC27A3Q5K4L6 KRT8P30-201ENST00000432100 650 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC27A3Q5K4L6 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC27A3Q5K4L6 AL132657.1-201ENST00000432530 712 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC27A3Q5K4L6 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC27A3Q5K4L6 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC27A3Q5K4L6 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC27A3Q5K4L6 AC092903.1-201ENST00000466506 262 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC27A3Q5K4L6 AC099548.2-201ENST00000491047 571 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC27A3Q5K4L6 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC27A3Q5K4L6 AP003351.1-201ENST00000522743 668 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC27A3Q5K4L6 URB1-AS1-201ENST00000534991 831 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC27A3Q5K4L6 AC004801.1-201ENST00000549557 360 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC27A3Q5K4L6 RBFOX3-206ENST00000582043 1143 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC27A3Q5K4L6 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC27A3Q5K4L6 AC009950.1-210ENST00000594622 553 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC27A3Q5K4L6 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC27A3Q5K4L6 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC27A3Q5K4L6 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC27A3Q5K4L6 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC27A3Q5K4L6 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC27A3Q5K4L6 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC27A3Q5K4L6 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC27A3Q5K4L6 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC27A3Q5K4L6 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC27A3Q5K4L6 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC27A3Q5K4L6 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC27A3Q5K4L6 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC27A3Q5K4L6 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC27A3Q5K4L6 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC27A3Q5K4L6 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC27A3Q5K4L6 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC27A3Q5K4L6 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC27A3Q5K4L6 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC27A3Q5K4L6 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC27A3Q5K4L6 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC27A3Q5K4L6 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC27A3Q5K4L6 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC27A3Q5K4L6 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC27A3Q5K4L6 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC27A3Q5K4L6 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC27A3Q5K4L6 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC27A3Q5K4L6 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC27A3Q5K4L6 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC27A3Q5K4L6 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC27A3Q5K4L6 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms