Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 RAB11FIP1-202ENST00000330843 7811 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 BCAS4-202ENST00000371608 6680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 PASK-203ENST00000403638 5161 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 SCOC-210ENST00000608372 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 FOXK1-201ENST00000328914 11181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 ZNF236-202ENST00000320610 7124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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