Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABRA6Q16445 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms