Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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PDCD1Q15116 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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