Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
GTF2H3Q13889 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GTF2H3Q13889 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
GTF2H3Q13889 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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GTF2H3Q13889 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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GTF2H3Q13889 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GTF2H3Q13889 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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GTF2H3Q13889 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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GTF2H3Q13889 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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GTF2H3Q13889 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GTF2H3Q13889 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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GTF2H3Q13889 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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GTF2H3Q13889 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GTF2H3Q13889 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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GTF2H3Q13889 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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GTF2H3Q13889 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GTF2H3Q13889 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GTF2H3Q13889 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GTF2H3Q13889 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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GTF2H3Q13889 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GTF2H3Q13889 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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GTF2H3Q13889 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GTF2H3Q13889 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GTF2H3Q13889 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
GTF2H3Q13889 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
GTF2H3Q13889 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GTF2H3Q13889 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GTF2H3Q13889 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GTF2H3Q13889 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GTF2H3Q13889 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GTF2H3Q13889 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GTF2H3Q13889 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GTF2H3Q13889 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GTF2H3Q13889 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GTF2H3Q13889 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GTF2H3Q13889 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GTF2H3Q13889 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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