Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
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