Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CUL3Q13618 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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