Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 AKIP1-203ENST00000309377 1327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
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PTPN13Q12923 RNF181-203ENST00000441634 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
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PTPN13Q12923 FAM86JP-202ENST00000484500 988 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 AC112694.1-202ENST00000540985 943 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 CSAG3-201ENST00000599845 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 CSAG2-203ENST00000638741 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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PTPN13Q12923 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
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PTPN13Q12923 AC093106.1-201ENST00000437271 352 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 C11orf45-202ENST00000524878 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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PTPN13Q12923 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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PTPN13Q12923 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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PTPN13Q12923 AC145422.1-201ENST00000541574 544 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 BLOC1S1-203ENST00000548925 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 NPAS3-209ENST00000551008 1002 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 AL445363.2-201ENST00000554608 837 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
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PTPN13Q12923 HAMP-203ENST00000598398 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 AL445363.1-201ENST00000623749 952 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 AK6-202ENST00000380822 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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