Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 SPATS2-201ENST00000321898 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 TBC1D3P2-203ENST00000581291 2088 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 FAM118A-201ENST00000216214 3458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 SETD3-204ENST00000436070 2592 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 YTHDF3-201ENST00000517371 3122 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC12.01□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 PDE4DIP-227ENST00000529945 8824 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.01□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms