Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA6P23229 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms