Protein–RNA interactions for Protein: P17600

SYN1, Synapsin-1, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN1P17600 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYN1P17600 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYN1P17600 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYN1P17600 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYN1P17600 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYN1P17600 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYN1P17600 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYN1P17600 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYN1P17600 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYN1P17600 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYN1P17600 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYN1P17600 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYN1P17600 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SYN1P17600 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYN1P17600 KRT8P30-201ENST00000432100 650 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SYN1P17600 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYN1P17600 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYN1P17600 HIST1H2APS2-201ENST00000454426 370 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SYN1P17600 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYN1P17600 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SYN1P17600 KNOP1P1-201ENST00000542108 989 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SYN1P17600 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYN1P17600 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SYN1P17600 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYN1P17600 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYN1P17600 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYN1P17600 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYN1P17600 TNFRSF12A-204ENST00000573001 648 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYN1P17600 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYN1P17600 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYN1P17600 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYN1P17600 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYN1P17600 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYN1P17600 COLQ-202ENST00000383786 1482 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYN1P17600 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYN1P17600 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYN1P17600 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYN1P17600 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYN1P17600 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYN1P17600 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYN1P17600 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYN1P17600 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYN1P17600 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYN1P17600 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYN1P17600 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYN1P17600 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYN1P17600 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYN1P17600 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYN1P17600 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYN1P17600 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYN1P17600 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYN1P17600 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYN1P17600 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYN1P17600 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYN1P17600 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYN1P17600 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYN1P17600 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYN1P17600 C18orf21-202ENST00000333234 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYN1P17600 HHLA3-202ENST00000361764 692 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYN1P17600 AC093609.1-201ENST00000434020 952 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYN1P17600 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SYN1P17600 AC002127.2-201ENST00000444032 792 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYN1P17600 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYN1P17600 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYN1P17600 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SYN1P17600 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYN1P17600 AC007298.2-201ENST00000551849 862 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYN1P17600 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYN1P17600 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SYN1P17600 AC009163.5-202ENST00000571737 466 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYN1P17600 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SYN1P17600 AC092073.1-202ENST00000606020 653 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYN1P17600 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYN1P17600 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYN1P17600 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYN1P17600 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYN1P17600 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYN1P17600 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYN1P17600 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYN1P17600 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYN1P17600 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYN1P17600 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYN1P17600 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYN1P17600 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYN1P17600 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYN1P17600 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYN1P17600 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYN1P17600 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYN1P17600 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYN1P17600 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYN1P17600 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYN1P17600 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SYN1P17600 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYN1P17600 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYN1P17600 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYN1P17600 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYN1P17600 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYN1P17600 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYN1P17600 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYN1P17600 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms