Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PGA3P0DJD8 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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