Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXB7P09629 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXB7P09629 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXB7P09629 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXB7P09629 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXB7P09629 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXB7P09629 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXB7P09629 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXB7P09629 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXB7P09629 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXB7P09629 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXB7P09629 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXB7P09629 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXB7P09629 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXB7P09629 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXB7P09629 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXB7P09629 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXB7P09629 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXB7P09629 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXB7P09629 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXB7P09629 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXB7P09629 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXB7P09629 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXB7P09629 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXB7P09629 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXB7P09629 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXB7P09629 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB7P09629 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB7P09629 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB7P09629 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB7P09629 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB7P09629 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB7P09629 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB7P09629 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB7P09629 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB7P09629 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB7P09629 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB7P09629 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB7P09629 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB7P09629 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB7P09629 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB7P09629 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB7P09629 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB7P09629 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB7P09629 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB7P09629 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB7P09629 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB7P09629 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB7P09629 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB7P09629 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB7P09629 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB7P09629 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB7P09629 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB7P09629 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB7P09629 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB7P09629 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB7P09629 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB7P09629 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB7P09629 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB7P09629 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB7P09629 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB7P09629 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB7P09629 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB7P09629 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB7P09629 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB7P09629 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB7P09629 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB7P09629 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB7P09629 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB7P09629 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB7P09629 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB7P09629 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB7P09629 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB7P09629 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB7P09629 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB7P09629 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB7P09629 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB7P09629 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB7P09629 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB7P09629 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB7P09629 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB7P09629 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB7P09629 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB7P09629 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB7P09629 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB7P09629 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB7P09629 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB7P09629 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB7P09629 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB7P09629 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB7P09629 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB7P09629 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB7P09629 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB7P09629 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB7P09629 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB7P09629 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB7P09629 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB7P09629 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB7P09629 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB7P09629 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms