Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 SLC4A7-203ENST00000425128 7970 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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ZNF879B4DU55 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF879B4DU55 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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ZNF879B4DU55 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ZNF879B4DU55 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ZNF879B4DU55 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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ZNF879B4DU55 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ZNF879B4DU55 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ZNF879B4DU55 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ZNF879B4DU55 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ZNF879B4DU55 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
ZNF879B4DU55 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ZNF879B4DU55 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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ZNF879B4DU55 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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ZNF879B4DU55 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ZNF879B4DU55 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ZNF879B4DU55 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ZNF879B4DU55 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF879B4DU55 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF879B4DU55 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF879B4DU55 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF879B4DU55 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF879B4DU55 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF879B4DU55 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF879B4DU55 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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ZNF879B4DU55 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF879B4DU55 UBE3A-226ENST00000637886 8725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF879B4DU55 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF879B4DU55 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF879B4DU55 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF879B4DU55 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF879B4DU55 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF879B4DU55 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF879B4DU55 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF879B4DU55 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF879B4DU55 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF879B4DU55 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF879B4DU55 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF879B4DU55 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF879B4DU55 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF879B4DU55 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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