Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms