Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVK-5Q9HDB9 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms